吉安市疾病预防控制中心是由政府举办的实施市级疾病预防控制与公共卫生技术管理和服务的公益事业单位。
现有编制75人，实有76人，离退休人员31人，内设13个科室（办公室、业务信息科、公共卫生科、职业病防制所、传染病防制所、性病艾滋病防制科、结核病防治所、地方病慢病科、免疫规划科、疾病控制检验所、卫生检测检验所、预防医学门诊部、药品采购中心）。
基本职能为疾病预防与控制、突发公共卫生事件应急处置、传染病疫情及相关信息的报告与管理、健康危害因素监测与控制、实施室检测分析与评价、健康教育与促进、技术指导与应用。主要职责:
1、对传染病、地方病、寄生虫病、慢性非传染性疾病、学生常见病及意外伤害、中毒等发生、分布和发展规律进行流行病学监测，并制定预防控制对策；对影响人群生存环境质量的危险因素进行卫生学监测。
2、为政府及其卫生行政部门提供决策咨询。
3、实施疾病预防控制工作方案对方案实施进行质量和效果评价。
4、对传染病的发生流行和中毒、污染事件进行调查处理，为救灾防病等重大公共卫生问题提供技术支持。
5、负责预防用生物制品的使用与管理。
6、负责人员培训和技术指导。
7、开展健康教育与健康促进，促进社会健康环境的建立和人群健康行为的形成。
8、承担疾病预防控制及有关公共卫生信息的报告、管理和预测、预报，为疾病预防控制决策提供科学依据。
9、开展卫生防病检验和实验室质量控制；受卫生行政认定，承担卫生监督监测检验、鉴定。
10、开展对外交流与合作，引进和推广新技术、新方法。
11、向社会提供相关的预防保健信息、健康咨询和预防医学诊疗等专业技术服务。